MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanolobus psychrophilus R15 chromosome

Total Repeats: 59207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018876	CAAG	2	8	22	29	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018876	AGT	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669211
3	NC_018876	TAT	2	6	194	199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669211
4	NC_018876	AAT	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669211
5	NC_018876	ATTG	2	8	246	253	25 %	50 %	25 %	0 %	410669211
6	NC_018876	AAG	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669211
7	NC_018876	AT	3	6	282	287	50 %	50 %	0 %	0 %	410669211
8	NC_018876	GAT	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669211
9	NC_018876	AT	3	6	383	388	50 %	50 %	0 %	0 %	410669211
10	NC_018876	TGTT	2	8	417	424	0 %	75 %	25 %	0 %	410669211
11	NC_018876	CTT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018876	ATAA	2	8	543	550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018876	GAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
14	NC_018876	GAA	2	6	591	596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669212
15	NC_018876	ATTG	2	8	648	655	25 %	50 %	25 %	0 %	410669212
16	NC_018876	AGAAC	2	10	691	700	60 %	0 %	20 %	20 %	410669212
17	NC_018876	GGC	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410669212
18	NC_018876	ACA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669212
19	NC_018876	AGAA	2	8	907	914	75 %	0 %	25 %	0 %	410669212
20	NC_018876	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	410669212
21	NC_018876	GAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
22	NC_018876	TGA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
23	NC_018876	A	7	7	1079	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	410669212
24	NC_018876	ATT	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669212
25	NC_018876	AGA	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669212
26	NC_018876	ACA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669212
27	NC_018876	ATCT	2	8	1195	1202	25 %	50 %	0 %	25 %	410669212
28	NC_018876	AGT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
29	NC_018876	GCA	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410669212
30	NC_018876	CTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410669212
31	NC_018876	ACA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669212
32	NC_018876	TGA	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
33	NC_018876	TCA	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669212
34	NC_018876	AAGG	2	8	1487	1494	50 %	0 %	50 %	0 %	410669212
35	NC_018876	AAC	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669213
36	NC_018876	A	7	7	1605	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	410669213
37	NC_018876	TCC	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410669213
38	NC_018876	TTAA	2	8	1672	1679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018876	CGT	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018876	GTT	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018876	ACT	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018876	TGCC	2	8	1902	1909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018876	AAT	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018876	TTCT	2	8	1978	1985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018876	TTC	2	6	2020	2025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018876	AC	3	6	2032	2037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018876	TAC	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018876	ATG	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018876	TAT	2	6	2240	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018876	T	6	6	2291	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018876	ATT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018876	GA	3	6	2356	2361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018876	GAAGG	2	10	2367	2376	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018876	ACA	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669214
55	NC_018876	TCCA	2	8	2439	2446	25 %	25 %	0 %	50 %	410669214
56	NC_018876	AGA	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669214
57	NC_018876	ACA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669214
58	NC_018876	AAGG	2	8	2542	2549	50 %	0 %	50 %	0 %	410669214
59	NC_018876	AGGA	2	8	2591	2598	50 %	0 %	50 %	0 %	410669214
60	NC_018876	TACA	2	8	2607	2614	50 %	25 %	0 %	25 %	410669214
61	NC_018876	AGG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669214
62	NC_018876	CAGT	2	8	2654	2661	25 %	25 %	25 %	25 %	410669214
63	NC_018876	TAT	2	6	2677	2682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669214
64	NC_018876	CAT	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669214
65	NC_018876	TGA	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669214
66	NC_018876	AAT	2	6	2786	2791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669214
67	NC_018876	ATC	2	6	2801	2806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018876	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018876	GTTGA	2	10	2855	2864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018876	AT	3	6	2956	2961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018876	ATCA	2	8	2978	2985	50 %	25 %	0 %	25 %	410669215
72	NC_018876	A	6	6	3014	3019	100 %	0 %	0 %	0 %	410669215
73	NC_018876	TTA	2	6	3031	3036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669215
74	NC_018876	GCT	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
75	NC_018876	AGATAC	2	12	3113	3124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410669215
76	NC_018876	GCCA	2	8	3141	3148	25 %	0 %	25 %	50 %	410669215
77	NC_018876	CTG	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
78	NC_018876	ATG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669215
79	NC_018876	CTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
80	NC_018876	ACC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410669215
81	NC_018876	AGA	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669215
82	NC_018876	CTG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
83	NC_018876	CGG	3	9	3307	3315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410669215
84	NC_018876	TTTGC	2	10	3342	3351	0 %	60 %	20 %	20 %	410669215
85	NC_018876	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669215
86	NC_018876	TAT	2	6	3392	3397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669215
87	NC_018876	ATG	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669215
88	NC_018876	AGT	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669215
89	NC_018876	T	6	6	3518	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	410669215
90	NC_018876	CAT	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669215
91	NC_018876	TAT	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669215
92	NC_018876	TCA	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669215
93	NC_018876	ATATA	2	10	3663	3672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018876	TA	4	8	3669	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018876	GTA	2	6	3750	3755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669216
96	NC_018876	CTG	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669216
97	NC_018876	CAG	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410669216
98	NC_018876	AAAT	2	8	3879	3886	75 %	25 %	0 %	0 %	410669216
99	NC_018876	TTA	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669216
100	NC_018876	TCA	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669216
101	NC_018876	AAAT	2	8	4032	4039	75 %	25 %	0 %	0 %	410669216
102	NC_018876	A	6	6	4041	4046	100 %	0 %	0 %	0 %	410669216
103	NC_018876	GGTT	2	8	4047	4054	0 %	50 %	50 %	0 %	410669216
104	NC_018876	GCT	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669216
105	NC_018876	ATC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669216
106	NC_018876	TC	3	6	4109	4114	0 %	50 %	0 %	50 %	410669216
107	NC_018876	T	7	7	4179	4185	0 %	100 %	0 %	0 %	410669216
108	NC_018876	GGA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669216
109	NC_018876	AATCT	2	10	4205	4214	40 %	40 %	0 %	20 %	410669216
110	NC_018876	AGA	2	6	4300	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669216
111	NC_018876	ATT	2	6	4320	4325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669216
112	NC_018876	AAG	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669216
113	NC_018876	TCA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669216
114	NC_018876	ATCT	2	8	4490	4497	25 %	50 %	0 %	25 %	410669216
115	NC_018876	CCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018876	AAAT	2	8	4875	4882	75 %	25 %	0 %	0 %	410669217
117	NC_018876	ACT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669217
118	NC_018876	AAT	2	6	5091	5096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669217
119	NC_018876	AGG	2	6	5097	5102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669217
120	NC_018876	TCA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669217
121	NC_018876	A	6	6	5142	5147	100 %	0 %	0 %	0 %	410669217
122	NC_018876	GATTT	2	10	5157	5166	20 %	60 %	20 %	0 %	410669217
123	NC_018876	TAA	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669217
124	NC_018876	AAGT	2	8	5313	5320	50 %	25 %	25 %	0 %	410669217
125	NC_018876	TCTT	2	8	5358	5365	0 %	75 %	0 %	25 %	410669217
126	NC_018876	AAT	2	6	5461	5466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018876	GTA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018876	ATC	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
129	NC_018876	TAA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669218
130	NC_018876	ATA	2	6	5586	5591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669218
131	NC_018876	TA	3	6	5741	5746	50 %	50 %	0 %	0 %	410669218
132	NC_018876	AT	3	6	5770	5775	50 %	50 %	0 %	0 %	410669218
133	NC_018876	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	410669218
134	NC_018876	ATC	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
135	NC_018876	AAT	2	6	5869	5874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669218
136	NC_018876	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669218
137	NC_018876	TCA	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
138	NC_018876	TTG	2	6	6073	6078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410669218
139	NC_018876	ATC	2	6	6114	6119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
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141	NC_018876	TCGT	2	8	6163	6170	0 %	50 %	25 %	25 %	410669218
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148	NC_018876	A	6	6	6478	6483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018876	TA	3	6	6485	6490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018876	CAA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018876	CAA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669219
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153	NC_018876	CT	3	6	6659	6664	0 %	50 %	0 %	50 %	410669219
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162	NC_018876	CA	4	8	6924	6931	50 %	0 %	0 %	50 %	410669219
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166	NC_018876	TTTG	2	8	7073	7080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_018876	GACC	2	8	11618	11625	25 %	0 %	25 %	50 %	410669225
264	NC_018876	GAA	2	6	11665	11670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669225
265	NC_018876	AGA	2	6	11783	11788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018876	AAT	2	6	11833	11838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_018876	AGG	2	6	11902	11907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_018876	TAT	2	6	11917	11922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018876	GT	3	6	12031	12036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018876	TGA	2	6	12094	12099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018876	CCT	2	6	12103	12108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_018876	ATC	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_018876	TCT	2	6	12150	12155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018876	TGA	2	6	12201	12206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_018876	GGA	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018876	TCA	2	6	12291	12296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_018876	CGATAC	2	12	12336	12347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_018876	TGG	2	6	12358	12363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_018876	TCG	2	6	12433	12438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_018876	ATAAG	2	10	12481	12490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_018876	GTA	2	6	12507	12512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018876	GAA	2	6	12554	12559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018876	TCC	2	6	12591	12596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_018876	AGG	2	6	12617	12622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_018876	A	6	6	13253	13258	100 %	0 %	0 %	0 %	410669226
296	NC_018876	TGA	2	6	13276	13281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669226
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299	NC_018876	TAC	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669226
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302	NC_018876	CTA	2	6	13489	13494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_018876	AAT	2	6	13532	13537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_018876	TA	3	6	13554	13559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_018876	T	7	7	14910	14916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_018876	TCT	2	6	15006	15011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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363	NC_018876	CAA	2	6	16551	16556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669230
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394	NC_018876	TGATC	2	10	18101	18110	20 %	40 %	20 %	20 %	410669231
395	NC_018876	TGTC	2	8	18160	18167	0 %	50 %	25 %	25 %	410669231
396	NC_018876	TC	3	6	18166	18171	0 %	50 %	0 %	50 %	410669231
397	NC_018876	CAC	2	6	18259	18264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410669231
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399	NC_018876	AAC	2	6	18342	18347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669231
400	NC_018876	GAA	2	6	18362	18367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669231
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403	NC_018876	CTCC	2	8	18996	19003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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